Gene Expression Profiling of Acute Lymphoblastic Leukemia in Children with Very Early Relapse
Por:
Núñez-Enríquez J.C., Bárcenas-López D.A., Hidalgo-Miranda A., Jiménez-Hernández E., Bekker-Méndez V.C., Flores-Lujano J., Solis-Labastida K.A., Martínez-Morales G.B., Sánchez-Muñoz F., Espinoza-Hernández L.E., Velázquez-Aviña M.M., Merino-Pasaye L.E., García Velázquez A.J., Pérez-Saldívar M.L., Mojica-Espinoza R., Ramírez-Bello J., Jiménez-Morales S., Mejía-Aranguré J.M.
Publicada:
1 ene 2016
Categoría:
Medicine (miscellaneous)
Resumen:
Background and Aims Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is the most common childhood cancer worldwide. Mexican patients have high mortality rates, low frequency of good prognosis biomarkers (i.e., ETV6-RUNX1) and a high proportion is classified at the time of diagnosis with a high risk to relapse according to clinical features. In addition, very early relapses are more frequently observed than in other populations. The aim of the study was to identify new potential biomarkers associated with very early relapse in Mexican ALL children through transcriptome analysis. Methods Microarray gene expression profiling on bone marrow samples of 54 pediatric ALL patients, collected at time of diagnosis and/or at relapse, was performed. Eleven patients presented relapse within the first 18 months after diagnosis. Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0 (HTA 2.0) was used to perform gene expression analysis. Annotation and functional enrichment analyses were carried out using Gene Ontology, KEGG pathway analysis and Ingenuity Pathway Analysis tools. Results BLVRB, ZCCHC7, PAX5, EBF1, TMOD1 and BLNK were differentially expressed (fold-change >2.0 and p value <0.01) between relapsed and non-relapsed patients. Functional analysis of abnormally expressed genes revealed their important role in cellular processes related to the development of hematological diseases, cancer, cell death and survival and in cell-to-cell signaling interaction. Conclusions Our data support previous findings showing the relevance of PAX5, EBF1 and ZCCHC7 as potential biomarkers to identify a subgroup of ALL children in high risk to relapse. © 2016 IMSS
Filiaciones:
Núñez-Enríquez J.C.:
Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) “Siglo XXI”, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico
Bárcenas-López D.A.:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), México City, Mexico
Hidalgo-Miranda A.:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), México City, Mexico
Jiménez-Hernández E.:
Servicio de Hematologia Pediatrica, Hospital General “Gaudencio González Garza”, Centro Medico Nacional (CMN) “La Raza”, IMSS, Mexico City, Mexico
Bekker-Méndez V.C.:
Unidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología “Dr. Daniel Méndez Hernández”, “La Raza”, IMSS, Mexico City, Mexico
Flores-Lujano J.:
Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) “Siglo XXI”, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico
Solis-Labastida K.A.:
Servicio de Hematología Pediátrica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) “Siglo XXI”, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico
Martínez-Morales G.B.:
Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) “Siglo XXI”, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico
Sánchez-Muñoz F.:
Departamento de Inmunología, Instituto Nacional de Cardiología “Ignacio Chávez” (INCICh), Mexico City, Mexico
Espinoza-Hernández L.E.:
Servicio de Hematologia Pediatrica, Hospital General “Gaudencio González Garza”, Centro Medico Nacional (CMN) “La Raza”, IMSS, Mexico City, Mexico
Velázquez-Aviña M.M.:
Servicio de Onco-Pediatría, Hospital Juárez de México, Secretaria de Salud (SSa), Mexico City, Mexico
Merino-Pasaye L.E.:
Servicio de Hematología Pediátrica, Centro Médico Nacional (CMN) “20 de Noviembre”, Instituto de Seguridad Social al Servicio de los Trabajadores del Estado (ISSSTE), Mexico City, Mexico
García Velázquez A.J.:
Servicio de Oncología, Hospital Pediátrico de Moctezuma, Secretaría de Salud Del D.F., Mexico City, Mexico
Pérez-Saldívar M.L.:
Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) “Siglo XXI”, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico
Mojica-Espinoza R.:
Unidad de Genotipificación y Análisis de Expresión, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico
Ramírez-Bello J.:
Unidad de Investigación de Enfermedades Metabólicas y Endócrinas, Hospital Juárez de México, Mexico City, Mexico
Jiménez-Morales S.:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), México City, Mexico
Mejía-Aranguré J.M.:
Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) “Siglo XXI”, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico
Coordinación de Investigación en Salud, Instituto Mexicano Del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico
Mexican Inter-Institutional Group for the Identification of the Causes of Childhood Leukaemia, Instituto Mexicano del Seguro Social, Instituto de Seguridad Social al Servicio de los Trabajadores del Estado, Secretaría de Salud, Secretaría de Salud del Gobierno del Distrito Federal, Mexico City, Mexico
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