Implication of myddosome complex genetic variants in outcome severity of COVID-19 patients
Por:
Martínez-Gómez L.E., Martinez-Armenta C., Medina-Luna D., Ordoñez-Sánchez M.L., Tusie-Luna T., Ortega-Peña S., Herrera-López B., Suarez-Ahedo C., Jimenez-Gutierrez G.E., Hidalgo-Bravo A., Vázquez-Cárdenas P., Vidal-Vázquez R.P., Ramírez-Hinojosa J.P., Martinez Matsumoto P.M., Vargas-Alarcón G., Posadas-Sánchez R., Fragoso J.-M., Martínez-Ruiz F.D.J., Zayago-Angeles D.M., Mata-Miranda M.M., Vázquez-Zapién G.J., Martínez-Cuazitl A., Andrade-Alvarado J., Granados J., Ramos-Tavera L., Camacho-Rea M.D.C., Segura-Kato Y., Rodríguez-Pérez J.M., Coronado-Zarco R., Franco-Cendejas R., López-Jácome L.E., Magaña J.J., Vela-Amieva M., Pineda C., Martínez-Nava G.A., López-Reyes A.
Publicada:
1 oct 2023
Ahead of Print:
1 oct 2023
Resumen:
Background/purpose(s): During a viral infection, the immune response is mediated by the toll-like receptors and myeloid differentiation Factor 88 (MyD88) that play an important role sensing infections such as SARS-CoV-2 which has claimed the lives of more than 6.8 million people around the world. Methods: We carried out a cross-sectional with a population of 618 SARS-CoV-2-positive unvaccinated subjects and further classified based on severity: 22% were mild, 34% were severe, 26% were critical, and 18% were deceased. Toll Like Receptor 7 (TLR7) single-nucleotide polymorphisms (rs3853839, rs179008, rs179009, and rs2302267) and MyD88 (rs7744) were genotyped using TaqMan OpenArray. The association of polymorphisms with disease outcomes was performed by logistic regression analysis adjusted by covariates. Results: A significant association of rs3853839 and rs7744 of the TLR7 and MyD88 genes, respectively, was found with COVID-19 severity. The G/G genotype of the rs3853839 TLR7 was associated with the critical outcome showing an Odd Ratio = 1.98 (95% IC = 1.04-3.77). The results highlighted an association of the G allele of MyD88 gene with severe, critical and deceased outcomes. Furthermore, in the dominant model (AG thorn GG vs. AA), we observed an Odd Ratio = 1.70 (95% CI = 1.02-2.86) with severe, Odd Ratio = 1.82 (95% CI = 1.04-3.21) with critical, and Odd Ratio = 2.44 (95% CI = 1.21-4.9) with deceased outcomes. Conclusion: To our knowledge this work represents an innovative report that highlights the significant association of TLR7 and MyD88 gene polymorphisms with COVID-19 outcomes and the possible implication of the MyD88 variant with D-dimer and IFN-a concentrations. Copyright 2023, Taiwan Society of Microbiology. Published by Elsevier Taiwan LLC. This is an open access article under the CC BY-NC-ND license (http://creativecommons.org/licenses/bync-nd/4.0/).
Filiaciones:
Martínez-Gómez L.E.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Martinez-Armenta C.:
Graduate Program in Experimental Biology, Dirección de Ciencias Biológicas y de la Salud (DCBS), Universidad Autónoma Metropolitana Iztapalapa, Ciudad de México, Mexico
Medina-Luna D.:
Microbiology & Immunology Department, Dalhousie University, Halifax, NS B3H4R2, Canada
Ordoñez-Sánchez M.L.:
Unidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Mexico
Tusie-Luna T.:
Unidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Mexico
Instituto de Investigaciones Biomédicas Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico
Ortega-Peña S.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Herrera-López B.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Suarez-Ahedo C.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Jimenez-Gutierrez G.E.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Hidalgo-Bravo A.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Vázquez-Cárdenas P.:
Centro de Innovación Médica Aplicada, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Ciudad de México, Mexico
Vidal-Vázquez R.P.:
Centro de Innovación Médica Aplicada, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Ciudad de México, Mexico
Ramírez-Hinojosa J.P.:
Centro de Innovación Médica Aplicada, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Ciudad de México, Mexico
Martinez Matsumoto P.M.:
Centro de Innovación Médica Aplicada, Hospital General Dr. Manuel Gea González, Ciudad de México, Mexico
Vargas-Alarcón G.:
Departamento de Biología Molecular y Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Ciudad de México, Mexico
Posadas-Sánchez R.:
Departamento de Biología Molecular y Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Ciudad de México, Mexico
Fragoso J.-M.:
Departamento de Biología Molecular y Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Ciudad de México, Mexico
Martínez-Ruiz F.D.J.:
Nuevo Hospital General Delegación Regional Sur de la Ciudad de México ISSSTE, Mexico
Zayago-Angeles D.M.:
Nuevo Hospital General Delegación Regional Sur de la Ciudad de México ISSSTE, Mexico
Mata-Miranda M.M.:
Laboratorio de Biología Celular y Tisular, Laboratorio de Embriología, Escuela Médico Militar, Universidad del Ejército y Fuerza Aérea, Ciudad de México, Mexico
Vázquez-Zapién G.J.:
Laboratorio de Biología Celular y Tisular, Laboratorio de Embriología, Escuela Médico Militar, Universidad del Ejército y Fuerza Aérea, Ciudad de México, Mexico
Martínez-Cuazitl A.:
Laboratorio de Biología Celular y Tisular, Laboratorio de Embriología, Escuela Médico Militar, Universidad del Ejército y Fuerza Aérea, Ciudad de México, Mexico
Andrade-Alvarado J.:
Servicio de Cirugía General, Hospital Central Norte Petróleos Mexicanos (PEMEX), Estado de México, Mexico
Granados J.:
Departamento de Inmunogenética, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
Ramos-Tavera L.:
Departamento de Inmunogenética, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
Camacho-Rea M.D.C.:
Departamento de Nutrición Animal, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Secretaria de Salud, Mexico City, Mexico
Segura-Kato Y.:
Unidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, Mexico
Rodríguez-Pérez J.M.:
Departamento de Biología Molecular y Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Ciudad de México, Mexico
Coronado-Zarco R.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Franco-Cendejas R.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
López-Jácome L.E.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Magaña J.J.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Vela-Amieva M.:
Laboratorio de Errores Innatos del Metabolismo y Tamiz, Instituto Nacional de Pediatría, Secretaria de Salud, Ciudad de México, Mexico
Pineda C.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
Martínez-Nava G.A.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
López-Reyes A.:
Laboratorio de Gerociencias, Dirección General, Medicina de Rehabilitación, Laboratorio de Infectología, Departamento de Reconstrucción Articular, Laboratorio de Medicina Genómica, Laboratorio Facilitador. Instituto Nacional de Rehabilitación Luis Guillermo Ibarra Ibarra, Secretaría de Salud, Ciudad de México, Mexico
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