Two-Component System Sensor Kinases from Asgardian Archaea May Be Witnesses to Eukaryotic Cell Evolution


Por: Padilla-Vaca F., De La Mora J., García-Contreras R., Ramírez-Prado J.H., Alva-Murillo N., Fonseca-Yepez S., Serna-Gutiérrez I., Moreno-Galván C.L., Montufar-Rodríguez J.M., Vicente-Gómez M., Rangel-Serrano Á., Vargas-Maya N.I., Franco B.

Publicada: 1 ene 2023
Resumen:
The signal transduction paradigm in bacteria involves two-component systems (TCSs). Asgardarchaeota are archaea that may have originated the current eukaryotic lifeforms. Most research on these archaea has focused on eukaryotic-like features, such as genes involved in phagocytosis, cytoskeleton structure, and vesicle trafficking. However, little attention has been given to specific prokaryotic features. Here, the sequence and predicted structural features of TCS sensor kinases analyzed from two metagenome assemblies and a genomic assembly from cultured Asgardian archaea are presented. The homology of the sensor kinases suggests the grouping of Lokiarchaeum closer to bacterial homologs. In contrast, one group from a Lokiarchaeum and a meta-genome assembly from Candidatus Heimdallarchaeum suggest the presence of a set of kinases separated from the typical bacterial TCS sensor kinases. AtoS and ArcB homologs were found in meta-genome assemblies along with defined domains for other well-characterized sensor kinases, suggesting the close link between these organisms and bacteria that may have resulted in the metabolic link to the establishment of symbiosis. Several kinases are predicted to be cytoplasmic; some contain several PAS domains. The data shown here suggest that TCS kinases in Asgardian bacteria are witnesses to the transition from bacteria to eukaryotic organisms. © 2023 by the authors.

Filiaciones:
Padilla-Vaca F.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico

De La Mora J.:
 Departamento de Genética Molecular, Instituto de Fisiologia Celular, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Circuito Exterior s/n, Mexico City, 04510, Mexico

García-Contreras R.:
 Departamento de Microbiología y Parasitología, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, 04510, Mexico

Ramírez-Prado J.H.:
 Unidad de Biotecnología, Centro de Investigación Científica de Yucatán, A. C, Mérida, 97205, Mexico

Alva-Murillo N.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico

Fonseca-Yepez S.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico

Serna-Gutiérrez I.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico

Moreno-Galván C.L.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico

Montufar-Rodríguez J.M.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico

Vicente-Gómez M.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico

Rangel-Serrano Á.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico

Vargas-Maya N.I.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico

Franco B.:
 Departamento de Biología, División de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Guanajuato, Noria Alta s/n, Guanajuato, 36050, Mexico
ISSN: 14203049
Editorial
MDPI AG, POSTFACH, CH-4005 BASEL, SWITZERLAND, Suiza
Tipo de documento: Article
Volumen: 28 Número: 13
Páginas:
WOS Id: 001028440700001
ID de PubMed: 37446705
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