Association Analysis Between the Functional Single Nucleotide Variants in miR-146a, miR-196a-2, miR-499a, and miR-612 With Acute Lymphoblastic Leukemia
Por:
Jimenez-Morales, Silvia, Núñez-Enríquez J.C., Cruz-Islas, Jazmin, Bekker-Méndez V.C., Jimenez-Hernandez, Elva, Medina-Sanson, Aurora, Olarte-Carrillo, Irma, Martinez-Tovar, Adolfo, Flores-Lujano, Janet, Ramirez-Bello, Julian, Pérez-Saldívar M.L., Martín-Trejo J.A., Perez-Lorenzana, Hector, Amador-Sanchez, Raquel, Mora-Ríos F.G., Peñaloza-González J.G., Duarte-Rodríguez D.A., Torres-Nava J.R., Flores-Bautista J.E., Espinosa-Elizondo R.M., Román-Zepeda P.F., Flores-Villegas L.V., Tamez-Gómez E.L., López-García V.H., Lara-Ramos J.R., González-Ulivarri J.E., Martínez-Silva S.I., Espinoza-Anrubio, Gilberto, Almeida-Hernandez, Carolina, Ramirez-Colorado, Rosario, Hernandez-Mora, Luis, García-López L.R., Cruz-Ojeda G.A., Godoy-Esquivel A.E., Contreras-Hernandez, Iris, Medina-Hernandez, Abraham, López-Caballero M.G., Hernández-Pineda N.A., Granados-Kraulles, Jorge, Rodríguez-Vázquez M.A., Torres-Valle, Delfino, Cortes-Reyes, Carlos, Medrano-Lopez, Francisco, Pérez-Gómez J.A., Martinez-Rios, Annel, Aguilar-De-los-Santos, Antonio, Serafin-Diaz, Berenice, Gutiérrez-Rivera M.D.L., Merino-Pasaye L.E., Vargas-Alarcon, Gilberto, Mata-Rocha, Minerva, Sepúlveda-Robles O.A., Rosas-Vargas, Haydee, Hidalgo-Miranda, Alfredo, Mejía-Aranguré J.M.
Publicada:
5 nov 2021
Resumen:
BackgroundAcute lymphoblastic leukemia (ALL) is characterized by an
abnormal proliferation of immature lymphocytes, in whose development
involves both environmental and genetic factors. It is well known that
single nucleotide polymorphisms (SNPs) in coding and noncoding genes
contribute to the susceptibility to ALL. This study aims to determine
whether SNPs in miR-146a, miR-196a-2, miR-499a, and miR-612 genes are
associated with the risk to ALL in pediatric Mexican population.
MethodsA multicenter case-control study was carried out including
patients with de novo diagnosis of ALL and healthy subjects as control
group. The DNA samples were obtained from saliva and peripheral blood,
and the genotyping of rs2910164, rs12803915, rs11614913, and rs3746444
was performed using the 5 ` exonuclease technique. Gene-gene interaction
was evaluated by the multifactor dimensionality reduction (MDR)
software. ResultsmiR-499a rs3746444 showed significant differences among
cases and controls. The rs3746444G allele was found as a risk factor to
ALL (OR, 1.6 [95% CI, 1.05-2.5]; p = 0.028). The homozygous GG
genotype of rs3746444 confers higher risk to ALL than the AA genotype
(OR, 5.3 [95% CI, 1.23-23.4]; p = 0.01). Moreover, GG genotype highly
increases the risk to ALL in male group (OR, 17.6 [95% CI,
1.04-298.9]; p = 0.00393). In addition, an association in a
gender-dependent manner among SNPs located in miR-146a and miR-196a-2
genes and ALL susceptibility was found. ConclusionOur findings suggest
that SNP located in miR-499a, miR-146a, and miR-196a-2 genes confer risk
to ALL in Mexican children. Experimental analysis to decipher the role
of these SNPs in human hematopoiesis could improve our understanding of
the molecular mechanism underlying the development of ALL.
Filiaciones:
Jimenez-Morales, Silvia:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico
Núñez-Enríquez J.C.:
Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría “Dr, Silvestre Frenk Freund”, Centro Médico Nacional “Siglo XXI”, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico
Cruz-Islas, Jazmin:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico
Bekker-Méndez V.C.:
Unidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología “Dr, Daniel Méndez Hernández”, La Raza”, IMSS, Mexico City, Mexico
Jimenez-Hernandez, Elva:
Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General “Gaudencio González Garza”, Centro Médico Nacional “La Raza”, IMSS, Mexico City, Mexico
Medina-Sanson, Aurora:
Departamento de Hemato-Oncología, Hospital Infantil de México Federico Gómez, Mexico City, Mexico
Olarte-Carrillo, Irma:
Servicio de Hematología, Departamento de Investigación, Hospital General de México Dr. Eduardo Liceaga, Mexico City, Mexico
Martinez-Tovar, Adolfo:
Servicio de Hematología, Departamento de Investigación, Hospital General de México Dr. Eduardo Liceaga, Mexico City, Mexico
Flores-Lujano, Janet:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico
Ramirez-Bello, Julian:
Departamento de Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología, Ignacio Chávez, México City, Mexico
Pérez-Saldívar M.L.:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico
Martín-Trejo J.A.:
Servicio de Hematología Pediátrica Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría “Dr, Silvestre Frenk Freund”, Centro Médico Nacional “Siglo XXI”, IMSS, Mexico City, Mexico
Perez-Lorenzana, Hector:
Servicio de Cirugía Pediátrica, Hospital General “Gaudencio González Garza”, Centro Médico Nacional (CMN), La Raza”, IMSS, Mexico City, Mexico
Amador-Sanchez, Raquel:
Servicio de Hematologia Pediatrica, Hospital General Regional “Carlos McGregor Sanchez Navarro”, IMSS, Mexico City, Mexico
Mora-Ríos F.G.:
Cirugía Pediátrica, Hospital Regional “General Ignacio Zaragoza”, Instituto de Seguridad y Servicios Sociales de los Trabajadores del Estado (ISSSTE), Mexico City, Mexico
Peñaloza-González J.G.:
Servicio de Onco-Pediatria, Hospital Juárez de México, Mexico City, Mexico
Duarte-Rodríguez D.A.:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico
Torres-Nava J.R.:
Servicio de Oncología, Hospital Pediátrico de Moctezuma, Secretaría de Salud de la Ciudad de México (SSCDMX), Mexico City, Mexico
Flores-Bautista J.E.:
Servicio de Pediatría, Hospital General de Tláhuac, Mexico City, Mexico
Espinosa-Elizondo R.M.:
Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General de México, Mexico City, Mexico
Román-Zepeda P.F.:
Coordinación Clínica y Servicio de Cirugía Pediátrica, Hospital General Regional (HGR), ”, IMSS, No. 1 “Dr. Carlos Mac Gregor Sánchez Navarro, Mexico City, Mexico
Flores-Villegas L.V.:
Servicio de Hematologia Pediatrica, Centro Medico Nacional “20 de Noviembre”, ISSSTE, Mexico City, Mexico
Tamez-Gómez E.L.:
Servicio de Hemato-Oncología Hospital Infantil de Tamaulipas, Cd. Victoria, Mexico
López-García V.H.:
Servicio de Hemato-Oncología Hospital Infantil de Tamaulipas, Cd. Victoria, Mexico
Lara-Ramos J.R.:
Servicio de Hemato-Oncología Hospital Infantil de Tamaulipas, Cd. Victoria, Mexico
González-Ulivarri J.E.:
Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico de Iztacalco, SSCDMX, Mexico City, Mexico
Martínez-Silva S.I.:
Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico de Iztapalapa, SSCDMX, Mexico City, Mexico
Espinoza-Anrubio, Gilberto:
Servicio de Pediatría, Hospital General Zona (HGZ), IMSS, No. 8 “Dr. Gilberto Flores Izquierdo”, Mexico City, Mexico
Almeida-Hernandez, Carolina:
Jefatura de Enseñanza, Hospital General de Ecatepec “Las Américas”, Instituto de Salud del Estado de México (ISEM), Mexico City, Mexico
Ramirez-Colorado, Rosario:
Jefatura de Enseñanza, SSCDMX, Hospital Pediátrico La Villa, Mexico City, Mexico
Hernandez-Mora, Luis:
Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico San Juan de Aragón, Secretaría de Salud (SS), Mexico City, Mexico
García-López L.R.:
Servicio de Pediatría, Hospital Pediátrico de Tacubaya, SSCDMX, Mexico City, Mexico
Cruz-Ojeda G.A.:
Coordinación Clínica de Educación e Investigación en Salud, IMSS, HGZ No. 47, Mexico City, Mexico
Godoy-Esquivel A.E.:
Servicio de Cirugía Pediátrica, Hospital Pediátrico de Moctezuma, SSCDMX, Mexico City, Mexico
Contreras-Hernandez, Iris:
Coordinación de Investigación en Salud, IMSS, Mexico City, Mexico
Medina-Hernandez, Abraham:
Hospital Materno-Pediátrico de Xochimilco, SSCDMX, Mexico City, Mexico
López-Caballero M.G.:
Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico de Coyoacán, SSCDMX, Mexico City, Mexico
Hernández-Pineda N.A.:
Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 76, IMSS, Mexico City, Mexico
Granados-Kraulles, Jorge:
Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 76, IMSS, Mexico City, Mexico
Rodríguez-Vázquez M.A.:
Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 68, IMSS, Mexico City, Mexico
Torres-Valle, Delfino:
Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 71, IMSS, Mexico City, Mexico
Cortes-Reyes, Carlos:
Hospital General Dr. Darío Fernández Fierro, ISSSTE, Mexico City, Mexico
Medrano-Lopez, Francisco:
Coordinación Clínica y Servicio de Pediatría, HGR No, IMSS, 72 “Dr. Vicente Santos Guajardo, Mexico City, Mexico
Pérez-Gómez J.A.:
Coordinación Clínica y Servicio de Pediatría, HGR No, IMSS, 72 “Dr. Vicente Santos Guajardo, Mexico City, Mexico
Martinez-Rios, Annel:
Cirugía Pediátrica del Hospital Regional “General Ignacio Zaragoza”, ISSSTE, Mexico City, Mexico
Aguilar-De-los-Santos, Antonio:
Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 98, IMSS, Mexico City, Mexico
Serafin-Diaz, Berenice:
Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 57, IMSS, Mexico City, Mexico
Gutiérrez-Rivera M.D.L.:
Servicio de Oncología Pediátrica Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría “Dr, Silvestre Frenk Freund”, IMSS, Mexico City, Mexico
Merino-Pasaye L.E.:
Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico de Iztapalapa, SSCDMX, Mexico City, Mexico
Vargas-Alarcon, Gilberto:
Departamento of Biología Molecular, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Mexico City, Mexico
Mata-Rocha, Minerva:
Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría “Dr, Silvestre Frenk Freund”, Centro Médico Nacional “Siglo XXI”, IMSS, Mexico City, Mexico
Sepúlveda-Robles O.A.:
Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría “Dr, Silvestre Frenk Freund”, Centro Médico Nacional “Siglo XXI”, IMSS, Mexico City, Mexico
Rosas-Vargas, Haydee:
Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría “Dr, Silvestre Frenk Freund”, Centro Médico Nacional “Siglo XXI”, IMSS, Mexico City, Mexico
Hidalgo-Miranda, Alfredo:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico
Mejía-Aranguré J.M.:
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico
Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría “Dr, Silvestre Frenk Freund”, Centro Médico Nacional “Siglo XXI”, IMSS, Mexico City, Mexico
Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico City, Mexico
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