Saliva is a reliable and accessible source for the detection of SARS-CoV-2
Por:
Herrera, Luis A., Hidalgo-Miranda, Alfredo, Reynoso-Noveron, Nancy, Meneses-Garcia, Abelardo A., Mendoza-Vargas, Alfredo, Reyes-Grajeda, Juan P., Vadillo-Ortega, Felipe, Cedro-Tanda, Alberto, Peñaloza F., Frias-Jimenez, Emmanuel, Arriaga-Canon, Cristian, Ruiz, Rosaura, Angulo, Ofelia, Lopez-Villasenor, Imelda, Amador-Bedolla, Carlos, Vilar-Compte, Diana, Cornejo, Patricia, Cisneros-Villanueva, Mireya, Hurtado-Cordova, Eduardo, Cendejas-Orozco, Mariana, Hernandez-Morales, Jose S., Moreno, Bernardo, Hernandez-Cruz, Irwin A., Herrera, Cesar A., Garcia, Francisco, Gonzalez-Woge, Miguel A., Munguia-Garza, Paulina, Luna-Maldonado, Fernando, Sanchez-Vizcarra, Antonia, Osnaya, Vincent G., Medina-Molotla, Nelly, Alfaro-Mora, Yair, Caceres-Gutierrez, Rodrigo E., Tolentino-Garcia, Laura, Rosas-Escobar, Patricia, Roman-Gonzalez, Sergio A., Escobar-Arrazola, Marco A., Canseco-Mendez, Julio C., Ortiz-Soriano, Diana R., Dominguez-Ortiz, Julieta, Gonzalez-Barrera, Ana D., Aparicio-Bautista, I, Diana, Cruz-Rangel, Armando, Alarcon-Zendejas, Ana Paula, Contreras-Espinosa, Laura, Gonzalez, Rodrigo, Guerra-Calderas, Lissania, Meraz-Rodriguez, Marco A., Montalvo-Casimiro, Michel, Montiel-Manriquez, Rogelio, Torres-Arciga, Karla, Venegas, Daniela, Juarez-Gonzalez, Vasti, Guajardo-Barreto, Xiadani, Monroy-Martinez, Veronica, Guillen, Daniel, Fernandez, Jacquelina, Herrera, Juliana, Leon-Rodriguez, Renato, Canela-Perez, Israel, Ruiz-Ordaz, Blanca H., Valdez-Vazquez, Rafael, Bertin-Montoya, Jennifer, Niembro-Ortega, Maria, Villegas-Acosta, Liudmila, Lopez-Castillo, Daniela, Soriano-Rios, Andrea, Gastelum-Ramos, Michael, Zamora-Barandas, Tonatiuh, Morales-Baez, Jorge, Garcia-Rodriguez, Maria, Garcia-Martinez, Mariano, Nieto-Patlan, Erik, Quirasco-Baruch, Maricarmen, Lopez-Martinez, Irma, Ramirez-Gonzalez, Ernesto, Olivera-Diaz, Hiram, Escobar-Escamilla, Noe
Publicada:
1 abr 2021
Resumen:
Objectives: The aim of this study was to investigate the feasibility of
saliva sampling as a non-invasive and safer tool to detect severe acute
respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and to compare its
reproducibility and sensitivity with nasopharyngeal swab samples (NPS).
The use of sample pools was also investigated.
Methods: A total of 2107 paired samples were collected from asymptomatic
healthcare and office workers in Mexico City. Sixty of these samples
were also analyzed in two other independent laboratories for concordance
analysis. Sample processing and analysis of virus genetic material were
performed according to standard protocols described elsewhere. A pooling
analysis was performed by analyzing the saliva pool and the individual
pool components.
Results: The concordance between NPS and saliva results was 95.2%
(kappa 0.727, p = 0.0001) and 97.9% without considering inconclusive
results (kappa 0.852, p = 0.0001). Saliva had a lower number of
inconclusive results than NPS (0.9% vs 1.9%). Furthermore, saliva
showed a significantly higher concentration of both total RNA and viral
copies than NPS. Comparison of our results with those of the other two
laboratories showed 100% and 97% concordance. Saliva samples are
stable without the use of any preservative, and a positive SARS-CoV-2
sample can be detected 5, 10, and 15 days after collection when the
sample is stored at 4 degrees C.
Conclusions: The study results indicate that saliva is as effective as
NPS for the identification of SARS-CoV-2-infected asymptomatic patients.
Sample pooling facilitates the analysis of a larger number of samples,
with the benefit of cost reduction. (C) 2021 The Author(s). Published by
Elsevier Ltd on behalf of International Society for Infectious Diseases.
Filiaciones:
Herrera, Luis A.:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Hidalgo-Miranda, Alfredo:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Reynoso-Noveron, Nancy:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Meneses-Garcia, Abelardo A.:
Instituto Nacional de Cancerología, INCAN, Mexico City, Mexico
Mendoza-Vargas, Alfredo:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Unidad de Secuenciación, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Reyes-Grajeda, Juan P.:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Unidad de Secuenciación, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Vadillo-Ortega, Felipe:
Unidad de Vinculación Científica Facultad de Medicina-INMEGEN, Mexico City, Mexico
Cedro-Tanda, Alberto:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Peñaloza F.:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Frias-Jimenez, Emmanuel:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Arriaga-Canon, Cristian:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Ruiz, Rosaura:
Secretaria de Educación, Ciencia, Tecnología e Innovación, Mexico City, Mexico
Angulo, Ofelia:
Secretaria de Educación, Ciencia, Tecnología e Innovación, Mexico City, Mexico
Lopez-Villasenor, Imelda:
Instituto de Investigaciones Biomedicas, Universidad Nacional Autónoma de Mexico, Mexico City, Mexico
Amador-Bedolla, Carlos:
Departamento de Física y Química Teórica, Facultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico
Vilar-Compte, Diana:
Instituto Nacional de Cancerología, INCAN, Mexico City, Mexico
Cornejo, Patricia:
Instituto Nacional de Cancerología, INCAN, Mexico City, Mexico
Cisneros-Villanueva, Mireya:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Hurtado-Cordova, Eduardo:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Cendejas-Orozco, Mariana:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Hernandez-Morales, Jose S.:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Unidad de Secuenciación, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Moreno, Bernardo:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Hernandez-Cruz, Irwin A.:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Herrera, Cesar A.:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Garcia, Francisco:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Gonzalez-Woge, Miguel A.:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Munguia-Garza, Paulina:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Luna-Maldonado, Fernando:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Sanchez-Vizcarra, Antonia:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Osnaya, Vincent G.:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Medina-Molotla, Nelly:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Unidad de Secuenciación, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Alfaro-Mora, Yair:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Caceres-Gutierrez, Rodrigo E.:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Tolentino-Garcia, Laura:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Rosas-Escobar, Patricia:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Unidad de Secuenciación, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Roman-Gonzalez, Sergio A.:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Escobar-Arrazola, Marco A.:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Canseco-Mendez, Julio C.:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Unidad de Secuenciación, Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Ortiz-Soriano, Diana R.:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Dominguez-Ortiz, Julieta:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Gonzalez-Barrera, Ana D.:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Aparicio-Bautista, I, Diana:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Cruz-Rangel, Armando:
Instituto Nacional de Medicina Genómica, INMEGEN, Mexico City, Mexico
Alarcon-Zendejas, Ana Paula:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Contreras-Espinosa, Laura:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Gonzalez, Rodrigo:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Guerra-Calderas, Lissania:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Meraz-Rodriguez, Marco A.:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Montalvo-Casimiro, Michel:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Montiel-Manriquez, Rogelio:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Torres-Arciga, Karla:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Venegas, Daniela:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Juarez-Gonzalez, Vasti:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Guajardo-Barreto, Xiadani:
Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología-Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, Mexico City, Mexico
Monroy-Martinez, Veronica:
Instituto de Investigaciones Biomedicas, Universidad Nacional Autónoma de Mexico, Mexico City, Mexico
Guillen, Daniel:
Instituto de Investigaciones Biomedicas, Universidad Nacional Autónoma de Mexico, Mexico City, Mexico
Fernandez, Jacquelina:
Instituto de Investigaciones Biomedicas, Universidad Nacional Autónoma de Mexico, Mexico City, Mexico
Herrera, Juliana:
Instituto de Investigaciones Biomedicas, Universidad Nacional Autónoma de Mexico, Mexico City, Mexico
Leon-Rodriguez, Renato:
Instituto de Investigaciones Biomedicas, Universidad Nacional Autónoma de Mexico, Mexico City, Mexico
Canela-Perez, Israel:
Instituto de Investigaciones Biomedicas, Universidad Nacional Autónoma de Mexico, Mexico City, Mexico
Ruiz-Ordaz, Blanca H.:
Instituto de Investigaciones Biomedicas, Universidad Nacional Autónoma de Mexico, Mexico City, Mexico
Valdez-Vazquez, Rafael:
Unidad Temporal COVID-19, Mexico City, Mexico
Bertin-Montoya, Jennifer:
Unidad Temporal COVID-19, Mexico City, Mexico
Niembro-Ortega, Maria:
Unidad Temporal COVID-19, Mexico City, Mexico
Villegas-Acosta, Liudmila:
Unidad Temporal COVID-19, Mexico City, Mexico
Lopez-Castillo, Daniela:
Unidad Temporal COVID-19, Mexico City, Mexico
Soriano-Rios, Andrea:
Unidad Temporal COVID-19, Mexico City, Mexico
Gastelum-Ramos, Michael:
Unidad Temporal COVID-19, Mexico City, Mexico
Zamora-Barandas, Tonatiuh:
Unidad Temporal COVID-19, Mexico City, Mexico
Morales-Baez, Jorge:
Unidad Temporal COVID-19, Mexico City, Mexico
Garcia-Rodriguez, Maria:
Unidad de Investigación Preclínica, Facultad de Química, Mexico City, Mexico
Garcia-Martinez, Mariano:
Unidad de Investigación Preclínica, Facultad de Química, Mexico City, Mexico
Nieto-Patlan, Erik:
Unidad de Investigación Preclínica, Facultad de Química, Mexico City, Mexico
Quirasco-Baruch, Maricarmen:
Departamento de Alimentos y Biotecnología, Facultad de Química, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico
Lopez-Martinez, Irma:
Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, InDRE, Mexico City, Mexico
Ramirez-Gonzalez, Ernesto:
Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, InDRE, Mexico City, Mexico
Olivera-Diaz, Hiram:
Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, InDRE, Mexico City, Mexico
Escobar-Escamilla, Noe:
Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, InDRE, Mexico City, Mexico
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