The genomic sequence of Exiguobacterium chiriqhucha str. N139 reveals a species that thrives in cold waters and extreme environmental conditions
Por:
Gutiérrez-Preciado A., Vargas-Chávez C., Reyes-Prieto M., Ordonez, Omar F., Santos-García D., Rosas-Pérez T., Valdivia-Anistro J., Rebollar E.A., Saralegui A., Moya A., Merino E., Farías M.E., Latorre A., Souza V.
Publicada:
19 abr 2017
Resumen:
We report the genome sequence of Exiguobacterium chiriqhucha str. N139,
isolated from a high-altitude Andean lake. Comparative genomic analyses
of the Exiguobacterium genomes available suggest that our strain belongs
to the same species as the previously reported E. pavilionensis str.
RW-2 and Exiguobacterium str. GIC 31. We describe this species and
propose the chiriqhucha name to group them. `Chiri qhucha' in Quechua
means `cold lake', which is a common origin of these three cosmopolitan
Exiguobacteria. The 2,952,588-bp E. chiriqhucha str. N139 genome
contains one chromosome and three megaplasmids. The genome analysis of
the Andean strain suggests the presence of enzymes that confer E.
chiriqhucha str. N139 the ability to grow under multiple environmental
extreme conditions, including high concentrations of different metals,
high ultraviolet B radiation, scavenging for phosphorous and coping with
high salinity. Moreover, the regulation of its tryptophan biosynthesis
suggests that novel pathways remain to be discovered, and that these
pathways might be fundamental in the amino acid metabolism of the
microbial community from Laguna Negra, Argentina.
Filiaciones:
Gutiérrez-Preciado A.:
Univ Valencia, Inst Cavanilles Biodiversidad & Biol Evolut, Unidad Genet Evolut, Calle Catedrat Jose Beltran Martinez, Valencia, Spain
Univ Paris Sud Paris XI, CNRS, AgroParisTech, Ecol Systemat Evolut, Orsay, France
Unidad de Genética Evolutiva, Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva, Universidad de Valencia Calle Catedrático José Beltrán Martínez Paterna, Valencia, Spain
Ecologie Systématique Evolution, CNRS AgroParisTech, Université Paris Sud (Paris XI), Orsay, France
Vargas-Chávez C.:
Univ Valencia, Inst Cavanilles Biodiversidad & Biol Evolut, Unidad Genet Evolut, Calle Catedrat Jose Beltran Martinez, Valencia, Spain
Unidad de Genética Evolutiva, Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva, Universidad de Valencia Calle Catedrático José Beltrán Martínez Paterna, Valencia, Spain
Reyes-Prieto M.:
Univ Valencia, Inst Cavanilles Biodiversidad & Biol Evolut, Unidad Genet Evolut, Calle Catedrat Jose Beltran Martinez, Valencia, Spain
Unidad de Genética Evolutiva, Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva, Universidad de Valencia Calle Catedrático José Beltrán Martínez Paterna, Valencia, Spain
Ordonez, Omar F.:
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Lab Invest Microbiol Lagunas Andinas, Planta Piloto Proc Ind Microbiol PROIMI, Av Belgrano & Pasaje Caseros, San Miguel De Tucuman, Tucuman, Argentina
Santos-García D.:
Univ Valencia, Inst Cavanilles Biodiversidad & Biol Evolut, Unidad Genet Evolut, Calle Catedrat Jose Beltran Martinez, Valencia, Spain
Hebrew Univ Jerusalem, Dept Entomol, Rehovot, Israel
Unidad de Genética Evolutiva, Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva, Universidad de Valencia Calle Catedrático José Beltrán Martínez Paterna, Valencia, Spain
Department of Entomology, Hebrew University of Jerusalem, Rehovot, Israel
Rosas-Pérez T.:
Univ Valencia, Inst Cavanilles Biodiversidad & Biol Evolut, Unidad Genet Evolut, Calle Catedrat Jose Beltran Martinez, Valencia, Spain
Unidad de Genética Evolutiva, Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva, Universidad de Valencia Calle Catedrático José Beltrán Martínez Paterna, Valencia, Spain
Valdivia-Anistro J.:
Univ Nacl Autonoma Mexico, Fac Estudios Super Zaragoza, Biol, Mexico City, DF, Mexico
Univ Nacl Autonoma Mexico Coyoacan, Inst Ecol, Dept Ecol Evolut, Mexico City, DF, Mexico
Carrera de Biología, Faculta de Estudios Superiores Zaragoza, UNAM, Mexico, Mexico
Departamento de Ecología Evolutiva, Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México coyoacan, Mexico, Mexico
Rebollar E.A.:
James Madison Univ, Dept Biol, Harrisonburg, VI USA
Department of Biology, James Madison University, Harrisonburg, VI, United States
Saralegui A.:
Univ Nacl Autonoma Mexico, Inst Biotecnol, Lab Nacl Microscopia Avanzada, Cuernavaca, Morelos, Mexico
Laboratorio Nacional de Microscopía Avanzada, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico
Moya A.:
Univ Valencia, Inst Cavanilles Biodiversidad & Biol Evolut, Unidad Genet Evolut, Calle Catedrat Jose Beltran Martinez, Valencia, Spain
Unidad de Genética Evolutiva, Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva, Universidad de Valencia Calle Catedrático José Beltrán Martínez Paterna, Valencia, Spain
Merino E.:
Univ Nacl Autonoma Mexico, Inst Biotecnol, Dept Microbiol Mol, Cuernavaca, Morelos, Mexico
Departamento de Microbiología Molecular, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico
Farías M.E.:
Consejo Nacl Invest Cient & Tecn, Lab Invest Microbiol Lagunas Andinas, Planta Piloto Proc Ind Microbiol PROIMI, Av Belgrano & Pasaje Caseros, San Miguel De Tucuman, Tucuman, Argentina
Laboratorio de Investigaciones Microbiológicas de Lagunas Andinas, Planta Piloto de Procesos Industriales Microbiológicos (PROIMI), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Av. Belgrano y Pasaje Caseros, San Miguel de Tucumán, Argentina
Latorre A.:
Univ Valencia, Inst Cavanilles Biodiversidad & Biol Evolut, Unidad Genet Evolut, Calle Catedrat Jose Beltran Martinez, Valencia, Spain
Unidad de Genética Evolutiva, Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva, Universidad de Valencia Calle Catedrático José Beltrán Martínez Paterna, Valencia, Spain
Souza V.:
Univ Nacl Autonoma Mexico Coyoacan, Inst Ecol, Dept Ecol Evolut, Mexico City, DF, Mexico
Departamento de Ecología Evolutiva, Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México coyoacan, Mexico, Mexico
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