Genomic characterization of two bacteriophages (vB_EcoS-phiEc3 and vB_EcoS-phiEc4) belonging to the genus Kagunavirus with lytic activity against uropathogenic Escherichia coli
Por:
Rodea, Gerardo E., Gonzalez-Villalobos, Edgar, Medina-Contreras, Oscar, Castelan-Sanchez, Hugo G., Aguilar-Rodea, Pamela, Velazquez-Guadarrama, Norma, Hernandez-Chinas, Ulises, Eslava-Campos, Carlos Alberto, Balcazar, Jose Luis, Molina-Lopez, Jose
Publicada:
1 ene 2022
Resumen:
In this study, the genomes of two lytic bacteriophages, vB_EcoS-phiEc3 and vB_EcoS-phiEc4, were sequenced and characterized using bioinformatics approaches. Whole-genome analysis showed that both phages belonged to the Kagunavirus genus, Guernseyvirinae subfamily and Siphoviridae family. Moreover, their genomes had 45, 288 bp and 44,540 bp, and G + C content of 48.42% and 50.04%, respectively. The genome of vB_EcoS-phiEc3 harbored 80 protein coding sequences (CDSs), whereas vB_EcoS-phiEc4 harbored 75 CDSs. Among them, 50 CDSs in vB_EcoS-phiEc3 and 44 CDSs in vB_EcoS-phiEc4 were considered as functional genes. Their lytic activity against multidrug-resistant uropathogenic Escherichia coli (UPEC) strains, as well as the absence of antibiotic resistance genes, lysogenic and virulence genes, enable vB_EcoS-phiEc3 and vB_EcoS-phiEc4 as a safe therapy option against UPEC infections. © 2022 Elsevier Ltd
Filiaciones:
Rodea, Gerardo E.:
Laboratorio de Patogenicidad Bacteriana, Unidad de Hemato-Oncología e Investigación, Hospital Infantil de México Federico Gómez/Facultad de Medicina UNAM, C.P., Mexico City, 06720, Mexico
Unidad de Investigación en Enfermedades Infecciosas Área de Genética Bacteriana, Hospital Infantil de México Federico Gómez, Ciudad de México, Mexico
Gonzalez-Villalobos, Edgar:
Catalan Institute for Water Research (ICRA), Girona, 17003, Spain
University of Girona, Girona, 17004, Spain
Medina-Contreras, Oscar:
Unidad de Investigación Epidemiológica en Endocrinología y Nutrición, Hospital Infantil de México Federico Gómez, Ciudad de México, Mexico
Castelan-Sanchez, Hugo G.:
Centro de Investigación en Dinámica Celular, Instituto de Ciencias Básicas y Aplicadas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos, Morelos, Cuernavaca, 62209, Mexico
Aguilar-Rodea, Pamela:
Unidad de Investigación en Enfermedades Infecciosas Área de Genética Bacteriana, Hospital Infantil de México Federico Gómez, Ciudad de México, Mexico
Velazquez-Guadarrama, Norma:
Unidad de Investigación en Enfermedades Infecciosas Área de Genética Bacteriana, Hospital Infantil de México Federico Gómez, Ciudad de México, Mexico
Hernandez-Chinas, Ulises:
Unidad Periférica de Investigación Básica y Clínica en Enfermedades Infecciosas, Departamento de Salud Pública/División de Investigación, Facultad de Medicina, UNAM, C.P., Mexico City, 04510, Mexico
Laboratorio de Patogenicidad Bacteriana, Unidad de Hemato-Oncología e Investigación, Hospital Infantil de México Federico Gómez/Facultad de Medicina UNAM, C.P., Mexico City, 06720, Mexico
Eslava-Campos, Carlos Alberto:
Unidad Periférica de Investigación Básica y Clínica en Enfermedades Infecciosas, Departamento de Salud Pública/División de Investigación, Facultad de Medicina, UNAM, C.P., Mexico City, 04510, Mexico
Laboratorio de Patogenicidad Bacteriana, Unidad de Hemato-Oncología e Investigación, Hospital Infantil de México Federico Gómez/Facultad de Medicina UNAM, C.P., Mexico City, 06720, Mexico
Balcazar, Jose Luis:
Catalan Institute for Water Research (ICRA), Girona, 17003, Spain
University of Girona, Girona, 17004, Spain
Molina-Lopez, Jose:
Unidad Periférica de Investigación Básica y Clínica en Enfermedades Infecciosas, Departamento de Salud Pública/División de Investigación, Facultad de Medicina, UNAM, C.P., Mexico City, 04510, Mexico
Laboratorio de Patogenicidad Bacteriana, Unidad de Hemato-Oncología e Investigación, Hospital Infantil de México Federico Gómez/Facultad de Medicina UNAM, C.P., Mexico City, 06720, Mexico
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