Draft genome sequence of Bacillus velezensis 2A-2B strain: A rhizospheric inhabitant of Sporobolus airoides (Torr.) Torr., with antifungal activity against root rot causing phytopathogens
Por:
Martinez-Raudales, Ines, De La Cruz-Rodriguez, Yumiko, Alvarado-Gutierrez, Alejandro, Vega-Arreguin, Julio, Fraire-Mayorga, Ahuitz, Alvarado-Rodriguez, Miguel, Balderas-Hernandez, Victor, Fraire-Velazquez, Saul
Publicada:
5 dic 2017
Categoría:
Genetics
Resumen:
A Bacillus velezensis strain from the rhizosphere of Sporobolus airoides (Torr.) Torr., a grass in central-north México, was isolated during a biocontrol of phytopathogens scrutiny study. The 2A-2B strain exhibited at least 60% of growth inhibition of virulent isolates of phytopathogens causing root rot. These phytopathogens include Phytophthora capsici, Fusarium solani, Fusarium oxysporum and Rhizoctonia solani. Furthermore, the 2A-2B strain is an indolacetic acid producer, and a plant inducer of PR1, which is an induced systemic resistance related gene in chili pepper plantlets. Whole genome sequencing was performed to generate a draft genome assembly of 3.953 MB with 46.36% of GC content, and a N50 of 294,737. The genome contains 3713 protein coding genes and 89 RNA genes. Moreover, comparative genome analysis revealed that the 2A-2B strain had the greatest identity (98.4%) with Bacillus velezensis. © 2017 The Author(s).
Filiaciones:
Martinez-Raudales, Ines:
Laboratorio Biología Integrativa de Plantas y Microorganismos, Unidad Académica de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Zacatecas, Av. Preparatoria s/n, Col. Agronómica, Zac. CP, Zacatecas, Mexico
Univ Autonoma Zacatecas, Unidad Acad Ciencias Biol, Lab Biol Integrat Plantas & Microorganismos, Av Preparatoria S-N, Zac 98067, Zacatecas, Mexico
De La Cruz-Rodriguez, Yumiko:
Laboratorio Biología Integrativa de Plantas y Microorganismos, Unidad Académica de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Zacatecas, Av. Preparatoria s/n, Col. Agronómica, Zac. CP, Zacatecas, Mexico
Univ Autonoma Zacatecas, Unidad Acad Ciencias Biol, Lab Biol Integrat Plantas & Microorganismos, Av Preparatoria S-N, Zac 98067, Zacatecas, Mexico
Alvarado-Gutierrez, Alejandro:
Laboratorio Biología Integrativa de Plantas y Microorganismos, Unidad Académica de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Zacatecas, Av. Preparatoria s/n, Col. Agronómica, Zac. CP, Zacatecas, Mexico
Univ Autonoma Zacatecas, Unidad Acad Ciencias Biol, Lab Biol Integrat Plantas & Microorganismos, Av Preparatoria S-N, Zac 98067, Zacatecas, Mexico
Vega-Arreguin, Julio:
ENES-León, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico
Univ Nacl Autonoma Mexico, ENES Leon, Mexico City, DF, Mexico
Fraire-Mayorga, Ahuitz:
Laboratorio Biología Integrativa de Plantas y Microorganismos, Unidad Académica de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Zacatecas, Av. Preparatoria s/n, Col. Agronómica, Zac. CP, Zacatecas, Mexico
Univ Autonoma Zacatecas, Unidad Acad Ciencias Biol, Lab Biol Integrat Plantas & Microorganismos, Av Preparatoria S-N, Zac 98067, Zacatecas, Mexico
Alvarado-Rodriguez, Miguel:
Laboratorio Biología Integrativa de Plantas y Microorganismos, Unidad Académica de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Zacatecas, Av. Preparatoria s/n, Col. Agronómica, Zac. CP, Zacatecas, Mexico
Univ Autonoma Zacatecas, Unidad Acad Ciencias Biol, Lab Biol Integrat Plantas & Microorganismos, Av Preparatoria S-N, Zac 98067, Zacatecas, Mexico
Balderas-Hernandez, Victor:
Laboratorio Biología Integrativa de Plantas y Microorganismos, Unidad Académica de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Zacatecas, Av. Preparatoria s/n, Col. Agronómica, Zac. CP, Zacatecas, Mexico
Univ Autonoma Zacatecas, Unidad Acad Ciencias Biol, Lab Biol Integrat Plantas & Microorganismos, Av Preparatoria S-N, Zac 98067, Zacatecas, Mexico
Fraire-Velazquez, Saul:
Laboratorio Biología Integrativa de Plantas y Microorganismos, Unidad Académica de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Zacatecas, Av. Preparatoria s/n, Col. Agronómica, Zac. CP, Zacatecas, Mexico
Univ Autonoma Zacatecas, Unidad Acad Ciencias Biol, Lab Biol Integrat Plantas & Microorganismos, Av Preparatoria S-N, Zac 98067, Zacatecas, Mexico
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